AT3G23000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.940 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CBL-interacting protein kinase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a serine/threonine protein kinase with similarities to CBL-interacting protein kinases, SNF1 and SOS2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CBL-interacting protein kinase 7 (CIPK7); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: response to fructose stimulus, response to sucrose stimulus, response to glucose stimulus; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), NAF/FISL domain (InterPro:IPR018451), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), NAF domain (InterPro:IPR004041), CBL-interacting protein kinase (InterPro:IPR020660), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CBL-interacting protein kinase 4 (TAIR:AT4G14580.1); Has 129268 Blast hits to 127250 proteins in 4353 species: Archae - 172; Bacteria - 15520; Metazoa - 47044; Fungi - 13122; Plants - 31560; Viruses - 528; Other Eukaryotes - 21322 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8172654..8173943 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48268.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 429 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESLPQPQNQ SSPATTPAKI LLGKYELGRR LGSGSFAKVH LARSIESDEL VAVKIIEKKK TIESGMEPRI IREIDAMRRL RHHPNILKIH EVMATKSKIY 101: LVMELASGGE LFSKVLRRGR LPESTARRYF QQLASALRFS HQDGVAHRDV KPQNLLLDEQ GNLKVSDFGL SALPEHLQNG LLHTACGTPA YTAPEVISRR 201: GYDGAKADAW SCGVILFVLL VGDVPFDDSN IAAMYRKIHR RDYRFPSWIS KQAKSIIYQM LDPNPVTRMS IETVMKTNWF KKSLETSEFH RNVFDSEVEM 301: KSSVNSITAF DLISLSSGLD LSGLFEAKKK KERRFTAKVS GVEVEEKAKM IGEKLGYVVK KKMMKKEGEV KVVGLGRGRT VIVVEAVELT VDVVVVEVKV 401: VEGEEDDSRW SDLITELEDI VLSWHNDIM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)