AT4G16350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcineurin B-like protein 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Calcium sensor protein. Binds CIPK14. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcineurin B-like protein 6 (CBL6); FUNCTIONS IN: calcium ion binding; INVOLVED IN: calcium-mediated signaling; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: sepal, male gametophyte, root, carpel, stamen; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Recoverin (InterPro:IPR001125), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcineurin B protein (InterPro:IPR015757), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcineurin B-like 3 (TAIR:AT4G26570.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:9242505..9243669 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26030.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 226 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMMQCLDGLK HLALILLTCC DADPPKVRQN PKDVARGTVF TVNEIEALYE LFKSISKNGL IDKEQFQLVL FKMNTTRSLF ADRVFDLFDT KNTGILDFEA 101: FARSLSVFHP NAKFEDKIEF SFKLYDLNQQ GYIKRQEVKQ MVVRTLAESG MNLSDHVIES IIDKTFEEAD TKLDGKIDKE EWRSLVLRHP SLLQNMSLQH 201: LKDVTKTFPN FVFHTIVTDT PSELDG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)