AT2G30360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : SOS3-interacting protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a SOS2-like protein kinase that is a member of the CBL-interacting protein kinase family.Loss of function mutants show a decrease in sensitivity to high pH.Phosphorylates AHA2, a plasma membrane H+ ATPase.This phosphorylation appears to regulate the activity of the proton transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
SOS3-interacting protein 4 (SIP4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), NAF/FISL domain (InterPro:IPR018451), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), NAF domain (InterPro:IPR004041), CBL-interacting protein kinase (InterPro:IPR020660), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine/threonine protein kinase 1 (TAIR:AT5G01820.1); Has 132389 Blast hits to 130226 proteins in 4650 species: Archae - 184; Bacteria - 15582; Metazoa - 48520; Fungi - 13393; Plants - 32054; Viruses - 541; Other Eukaryotes - 22115 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:12937265..12938572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49020.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 435 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPEIEIAAGS GDNNDALFGK YELGKLLGCG AFAKVFHARD RRTGQSVAVK ILNKKKLLTN PALANNIKRE ISIMRRLSHP NIVKLHEVMA TKSKIFFAME 101: FVKGGELFNK ISKHGRLSED LSRRYFQQLI SAVGYCHARG VYHRDLKPEN LLIDENGNLK VSDFGLSALT DQIRPDGLLH TLCGTPAYVA PEILSKKGYE 201: GAKVDVWSCG IVLFVLVAGY LPFNDPNVMN MYKKIYKGEY RFPRWMSPDL KRFVSRLLDI NPETRITIDE ILKDPWFVRG GFKQIKFHDD EIEDQKVESS 301: LEAVKSLNAF DLISYSSGLD LSGLFAGCSN SSGESERFLS EKSPEMLAEE VEGFAREENL RMKKKKEEEY GFEMEGQNGK FGIGICISRL NDLLVVVEAR 401: RRGGDGDCYK EMWNGKLRVQ LIRVCDQTSS TNAAI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)