AT4G01420.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcineurin B-like protein 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes calcineurin B-like protein 5 (CBL5). Overexpression confers tolerance to drought and salt stress. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcineurin B-like protein 5 (CBL5); FUNCTIONS IN: calcium ion binding; INVOLVED IN: response to salt stress, response to water deprivation, N-terminal protein myristoylation, calcium-mediated signaling, response to osmotic stress; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: stem, flower, leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Recoverin (InterPro:IPR001125), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcineurin B protein (InterPro:IPR015757), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Calcium-binding EF-hand family protein (TAIR:AT5G24270.2); Has 5545 Blast hits to 5527 proteins in 657 species: Archae - 0; Bacteria - 7; Metazoa - 2787; Fungi - 925; Plants - 1302; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 524 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:580038..581518 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23519.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 203 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGCVCSKQLE GRRQEDISLL ASQTFFSEAE VEVLHGLFIK LTSCLSNDNL LTKEKFQFIL IKNTKKRSLS AERIFGLFDM RNDGAIDFGE FVHTLNIFHP 101: NSSPRDKAIF AFRLYDTRET GFIEPEEVKE MIIDVLEESE LMLSESIIDS IVSKTFEEAD WKKDGIIDLE EWENFVATYP LTLKNMTIPF LKDIPRIFPT 201: FLR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)