AT3G10525.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : LOSS OF GIANT CELLS FROM ORGANS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes LGO (loss of giant cells from organs) required for giant cell formation. Giant cells in both leaves and sepals are absent in lgo mutants. LGO is a member of a plant specific cell cycle inhibitor family SIAMESE and was originally named as SMR1(SIAMESE RELATED 1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
LOSS OF GIANT CELLS FROM ORGANS (LGO); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cyclin-dependent protein kinase inhibitors (TAIR:AT5G04470.1); Has 43 Blast hits to 43 proteins in 10 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 39; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3281576..3281962 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14614.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 128 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDLELLQDLS KFNFPTPIKI RSKTSKTKKD EGDDDEDDLR CSTPTSQEHK IPAVVDSPPP PPRKPRPPPS APSATAALMI RSCKRKLLVS TCEIIMNREE 101: IDRFFSSVYN ETSTTAKRRR SYPYCSRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)