AT2G37500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arginine biosynthesis protein ArgJ family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
arginine biosynthesis protein ArgJ family; FUNCTIONS IN: glutamate N-acetyltransferase activity; INVOLVED IN: arginine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Arginine biosynthesis protein ArgJ (InterPro:IPR002813), Peptidase S58 DmpA/arginine biosynthesis protein ArgJ (InterPro:IPR016117); Has 5525 Blast hits to 5515 proteins in 1540 species: Archae - 87; Bacteria - 2817; Metazoa - 2; Fungi - 139; Plants - 50; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2430 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15739904..15742689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48716.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 468 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MHSCSHTHFV SFKLPHFFAP KSFVVSSRRE LRVFAVATTV EEASGNIPAA PISLPQGSWK QIAGGVTAAK GFKAAGMYAG LRAAGKKPDL ALVTCDVEAV 101: AAGVFTTNVV AAAPVVYCKK VLETSKTARA VLINAGQANA ATGDAGYQDM LDCVGSIATL LKVKPEEVLI ESTGVIGQRI KKEELLHALP TLVNSRSDSV 201: EEADSAAVAI TTTDLVSKSV AVESQVGGIK IRVGGMAKGS GMIHPNMATM LGVITTDALV ESDIWRKMVK VAVNRSFNQI TVDGDTSTND TVIALASGLS 301: GSPSISSLNC KEAAQLQACL DAVMQGLAKS IAWDGEGATC LIEVTVKGTE TEAEAAKIAR SVASSSLVKA AVYGRDPNWG RIAAAAGYAG VSFQMDKLKI 401: SLGEFSLMES GQPLPFDRDG ASNYLKKTGE VHGTVTIDIS VGDGAAIGKA WGCDLSYDYV KINAEYTS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)