AT3G57610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : adenylosuccinate synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encoding adenylosuccinate synthetase (AdSS), the enzyme involved in the first step of the formation of the purine nucleotide AMP (conversion of IMP to adenylo-succinate) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
adenylosuccinate synthase (ADSS); FUNCTIONS IN: adenylosuccinate synthase activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, purine ribonucleotide biosynthetic process, AMP biosynthetic process; LOCATED IN: apoplast, chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenylosuccinate synthase, active site (InterPro:IPR018220), Adenylosuccinate synthetase (InterPro:IPR001114); Has 10496 Blast hits to 10490 proteins in 2781 species: Archae - 222; Bacteria - 5613; Metazoa - 213; Fungi - 143; Plants - 71; Viruses - 18; Other Eukaryotes - 4216 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21334519..21336603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52967.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 490 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLSSLTLDS NPRFAVGGPY HRRYPPLHHP RSFVSCSAKR PAVSASLSVA ADSAATESLG RIGSLSQVSG VLGCQWGDEG KGKLVDILAQ HFDIVARCQG 101: GANAGHTIYN SEGKKFALHL VPSGILNEDT TCVIGNGVVV HLPGLFKEID GLESNGVSCK GRILVSDRAH LLFDFHQEVD GLRESELAKS FIGTTKRGIG 201: PAYSSKVIRN GIRVGDLRHM DTLPQKLDLL LSDAAARFQG FKYTPEMLRE EVEAYKRYAD RLEPYITDTV HFINDSISQK KKVLVEGGQA TMLDIDFGTY 301: PFVTSSSPSA GGICTGLGIA PSVVGDLIGV VKAYTTRVGS GPFPTENLGT GGDLLRLAGQ EFGTTTGRPR RCGWLDIVAL KFSCQINGFA SLNLTKLDVL 401: SDLNEIQLGV AYKRSDGTPV KSFPGDLRLL EELHVEYEVL PGWKSDISSV RNYSDLPKAA QQYVERIEEL VGVPIHYIGI GPGRDALIYK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)