AT3G58610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ketol-acid reductoisomerase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ketol-acid reductoisomerase; FUNCTIONS IN: copper ion binding, ketol-acid reductoisomerase activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, branched chain family amino acid biosynthetic process; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acetohydroxy acid isomeroreductase, catalytic (InterPro:IPR013116), 6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal-like (InterPro:IPR008927), Dehydrogenase, multihelical (InterPro:IPR013328), Acetohydroxy acid isomeroreductase C-terminal (InterPro:IPR000506), Ketol-acid reductoisomerase (InterPro:IPR016206), Acetohydroxy acid isomeroreductase (InterPro:IPR013023), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040); Has 7931 Blast hits to 7576 proteins in 2285 species: Archae - 226; Bacteria - 4872; Metazoa - 2; Fungi - 269; Plants - 111; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2451 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:21671561..21674639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63816.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 591 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAATSSIAP SLSCPSPSSS SKTLWSSKAR TLALPNIGFL SSSSKSLRSL TATVAGNGAT GSSLAARMVS SSAVKAPVSL DFETSVFKKE KVSLAGYEEY 101: IVRGGRDLFK HLPDAFKGIK QIGVIGWGSQ GPAQAQNLRD SLVEAKSDIV VKIGLRKGSR SFEEARAAGF TEESGTLGDI WETIAGSDLV LLLISDAAQA 201: DNYEKIFSHM KPNSILGLSH GFLLGHLQSS GLDFPKNISV VAVCPKGMGP SVRRLYVQGK EINGAGINAS FAVHQDVDGR AADVALGWSV ALGSPFTFAT 301: TLEQEYRSDI FGERGILLGA VHGIVESLFR RYTENGMSED LAYKNTVECI TGTISRTIST QGMLAVYNSL SEEGKKDFET AYSASFYPCM EILYECYEDV 401: QSGSEIRSVV LAGRRFYEKE GLPAFPMGNI DQTRMWKVGE RVRKSRPAGD LGPLYPFTAG VYVALMMAQI EILRKKGHSY SEIINESVIE SVDSLNPFMH 501: ARGVSFMVDN CSTTARLGSR KWAPRFDYIL TQQALVAVDS GAAINRDLIS NFFSDPVHGA IEVCAQLRPT VDISVPADAD FVRPELRQSS N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)