AT2G36750.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 0.839 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 73C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 73C1 (UGT73C1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: don-glucosyltransferase 1 (TAIR:AT2G36800.1); Has 7705 Blast hits to 7611 proteins in 415 species: Archae - 0; Bacteria - 205; Metazoa - 2197; Fungi - 31; Plants - 5129; Viruses - 79; Other Eukaryotes - 64 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15410531..15412006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 55226.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 491 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASEFRPPLH FVLFPFMAQG HMIPMVDIAR LLAQRGVTIT IVTTPQNAGR FKNVLSRAIQ SGLPINLVQV KFPSQESGSP EGQENLDLLD SLGASLTFFK 101: AFSLLEEPVE KLLKEIQPRP NCIIADMCLP YTNRIAKNLG IPKIIFHGMC CFNLLCTHIM HQNHEFLETI ESDKEYFPIP NFPDRVEFTK SQLPMVLVAG 201: DWKDFLDGMT EGDNTSYGVI VNTFEELEPA YVRDYKKVKA GKIWSIGPVS LCNKLGEDQA ERGNKADIDQ DECIKWLDSK EEGSVLYVCL GSICNLPLSQ 301: LKELGLGLEE SQRPFIWVIR GWEKYNELLE WISESGYKER IKERGLLITG WSPQMLILTH PAVGGFLTHC GWNSTLEGIT SGVPLLTWPL FGDQFCNEKL 401: AVQILKAGVR AGVEESMRWG EEEKIGVLVD KEGVKKAVEE LMGDSNDAKE RRKRVKELGE LAHKAVEEGG SSHSNITFLL QDIMQLEQPK K |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)