AT1G64900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.825 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 89, subfamily A, polypeptide 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes cytochrome P450 (CYP89A2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 89, subfamily A, polypeptide 2 (CYP89A2); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 87, subfamily A, polypeptide 6 (TAIR:AT1G64940.1); Has 33194 Blast hits to 33025 proteins in 1695 species: Archae - 48; Bacteria - 3766; Metazoa - 11768; Fungi - 7065; Plants - 9239; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1305 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:24113283..24114803 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58608.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 506 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEIWLLILAS LSGSLLLHLL LRRRNSSSPP LPPDPNFLPF LGTLQWLREG LGGLESYLRS VHHRLGPIVT LRITSRPAIF VADRSLTHEA LVLNGAVYAD 101: RPPPAVISKI VDEHNISSGS YGATWRLLRR NITSEILHPS RVRSYSHARH WVLEILFERF RNHGGEEPIV LIHHLHYAMF ALLVLMCFGD KLDEKQIKEV 201: EFIQRLQLLS LTKFNIFNIW PKFTKLILRK RWQEFLQIRR QQRDVLLPLI RARRKIVEER KRSEQEDKKD YVQSYVDTLL DLELPEENRK LNEEDIMNLC 301: SEFLTAGTDT TATALQWIMA NLVKYPEIQE RLHEEIKSVV GEEAKEVEEE DVEKMPYLKA VVLEGLRRHP PGHFLLPHSV TEDTVLGGYK VPKNGTINFM 401: VAEIGRDPVE WEEPMAFKPE RFMGEEEAVD LTGSRGIKMM PFGAGRRICP GIGLAMLHLE YYVANMVREF QWKEVQGHEV DLTEKLEFTV VMKHPLKALA 501: VPRRCH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)