AT2G31870.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.992 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
mutant has Long free-running circadian period; Poly (ADP-ribose) Glycohydrolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Sanskrit for 'bright' (TEJ); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Poly(ADP-ribose) glycohydrolase (InterPro:IPR007724); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 2 (TAIR:AT2G31865.2); Has 554 Blast hits to 370 proteins in 95 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 332; Fungi - 10; Plants - 60; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 152 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13549999..13553756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62173.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 548 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENREDLNSI LPYLPLVIRS SSLYWPPRVV EALKAMSEGP SHSQVDSGEV LRQAIFDMRR SLSFSTLEPS ASNGYAFLFD ELIDEKESKR WFDEIIPALA 101: SLLLQFPSLL EVHFQNADNI VSGIKTGLRL LNSQQAGIVF LSQELIGALL ACSFFCLFPD DNRGAKHLPV INFDHLFASL YISYSQSQES KIRCIMHYFE 201: RFCSCVPIGI VSFERKITAA PDADFWSKSD VSLCAFKVHS FGLIEDQPDN ALEVDFANKY LGGGSLSRGC VQEEIRFMIN PELIAGMLFL PRMDDNEAIE 301: IVGAERFSCY TGYASSFRFA GEYIDKKAMD PFKRRRTRIV AIDALCTPKM RHFKDICLLR EINKALCGFL NCSKAWEHQN IFMDEGDNEI QLVRNGRDSG 401: LLRTETTASH RTPLNDVEMN REKPANNLIR DFYVEGVDNE DHEDDGVATG NWGCGVFGGD PELKATIQWL AASQTRRPFI SYYTFGVEAL RNLDQVTKWI 501: LSHKWTVGDL WNMMLEYSAQ RLYKQTSVGF FSWLLPSLAT TNKAIQPP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)