AT2G25090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.786 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CBL-interacting protein kinase 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the SNF1-related kinase (SnRK) gene family (SnRK3.18), which has also been reported as a member of the CBL-interacting protein kinases (CIPK16). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CBL-interacting protein kinase 16 (CIPK16); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: signal transduction, protein amino acid phosphorylation; EXPRESSED IN: stem, root, stamen; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), NAF/FISL domain (InterPro:IPR018451), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), NAF domain (InterPro:IPR004041), CBL-interacting protein kinase (InterPro:IPR020660), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CBL-interacting protein kinase 5 (TAIR:AT5G10930.1); Has 131103 Blast hits to 128839 proteins in 4426 species: Archae - 199; Bacteria - 15263; Metazoa - 48327; Fungi - 13205; Plants - 31908; Viruses - 544; Other Eukaryotes - 21657 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10670542..10672610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53554.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 469 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEESNRSSTV LFDKYNIGRL LGTGNFAKVY HGTEISTGDD VAIKVIKKDH VFKRRGMMEQ IEREIAVMRL LRHPNVVELR EVMATKKKIF FVMEYVNGGE 101: LFEMIDRDGK LPEDLARKYF QQLISAVDFC HSRGVFHRDI KPENLLLDGE GDLKVTDFGL SALMMPEGLG GRRGSSDDLL HTRCGTPAYV APEVLRNKGY 201: DGAMADIWSC GIVLYALLAG FLPFIDENVM TLYTKIFKAE CEFPPWFSLE SKELLSRLLV PDPEQRISMS EIKMIPWFRK NFTPSVAFSI DETIPSPPEP 301: PTKKKKKDLN EKEDDGASPR SFNAFQFITS MSSGFDLSNL FEIKRKPKRM FTSKFPAKSV KERLETAARE MDMRVKHVKD CKMKLQRRTE GRKGRLSVTA 401: EVFEVAPEVS VVEFCKTSGD TLEYYLFCED DVRPALKDIV WSWQGDDDED DVTTNDNVDT NDNKINNVS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)