AT2G23640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.617 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Reticulan like protein B13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Reticulan like protein B13 (RTNLB13); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Reticulon (InterPro:IPR003388); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Reticulon family protein (TAIR:AT3G10915.3); Has 751 Blast hits to 751 proteins in 54 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 324; Fungi - 0; Plants - 418; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:10057554..10059042 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23772.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 206 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANDVTKDPT PKSDIVEDIY LWRRKKLAFS TLLVSTSTWI LLSFYGFTTI TIVSWIGIAV VSMIFLWGSL LRLLSKVEPE LSGLEVSEEF VVETVRSCRM 101: LMEEMVRWMF RVGAESEWFV FARTVLGFWI LSRIGNLLDF HTCLFIGLVM GLTVPKLWEE YGDQIQKHLG SLKDKSKGAY NTTHEKILEM KNKLHHGTEE 201: KVKKSE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)