AT5G22470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.896 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD+ ADP-ribosyltransferases;NAD+ ADP-ribosyltransferases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NAD+ ADP-ribosyltransferases;NAD+ ADP-ribosyltransferases; FUNCTIONS IN: NAD+ ADP-ribosyltransferase activity; INVOLVED IN: protein amino acid ADP-ribosylation; LOCATED IN: intracellular, nucleus; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WGR (InterPro:IPR008893), Poly(ADP-ribose) polymerase, regulatory domain (InterPro:IPR004102), PADR1 (InterPro:IPR012982), Poly(ADP-ribose) polymerase, catalytic domain (InterPro:IPR012317), BRCT (InterPro:IPR001357); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: poly(ADP-ribose) polymerase 2 (TAIR:AT2G31320.1); Has 672 Blast hits to 662 proteins in 152 species: Archae - 0; Bacteria - 20; Metazoa - 347; Fungi - 74; Plants - 111; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 118 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:7447045..7450743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 91410.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 814 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKVHETRSHA HMSGDEQKGN LRKHKAEGKL PESEQSQKKA KPENDDGRSV NGAGDAASEY NEFCKAVEEN LSIDQIKEVL EINGQDCSAP EETLLAQCQD 101: LLFYGALAKC PLCGGTLICD NEKRFVCGGE ISEWCSCVFS TKDPPRKEEP VKIPDSVMNS AISDLIKKHQ DPKSRPKREL GSADKPFVGM MISLMGRLTR 201: THQYWKKKIE RNGGKVSNTV QGVTCLVVSP AERERGGTSK MVEAMEQGLP VVSEAWLIDS VEKHEAQPLE AYDVVSDLSV EGKGIPWDKQ DPSEEAIESF 301: SAELKMYGKR GVYMDTKLQE RGGKIFEKDG LLYNCAFSIC DLGKGRNEYC IMQLVTVPDS NLNMYFKRGK VGDDPNAEER LEEWEDEEAA IKEFARLFEE 401: IAGNEFEPWE REKKIQKKPH KFFPIDMDDG IEVRSGALGL RQLGIASAHC KLDSFVANFI KVLCGQEIYN YALMELGLDP PDLPMGMLTD IHLKRCEEVL 501: LEFVEKVKTT KETGQKAEAM WADFSSRWFS LMHSTRPMRL HDVNELADHA ASAFETVRDI NTASRLIGDM RGDTLDDPLS DRYKKLGCKI SVVDKESEDY 601: KMVVKYLETT YEPVKVSDVE YGVSVQNVFA VESDAIPSLD DIKKLPNKVL LWCGSRSSNL LRHIYKGFLP AVCSLPVPGY MFGRAIVCSD AAAEAARYGF 701: TAVDRPEGFL VLAVASLGEE VTEFTSPPED TKTLEDKKIG VKGLGRKKTE ESEHFMWRDD IKVPCGRLVP SEHKDSPLEY NEYAVYDPKQ TSIRFLVEVK 801: YEEKGTEIVD VEPE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)