AT2G22570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.991 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nicotinamidase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a nicotinamidase that converts nicotinamide into nicotinic acid. As such the encoded enzyme is involved in the pyridine nucleotide salvage pathway which may be connected to the de novo NAD biosynthesis through the ABA signaling pathway. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nicotinamidase 1 (NIC1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Isochorismatase-like (InterPro:IPR000868); Has 1180 Blast hits to 1180 proteins in 562 species: Archae - 22; Bacteria - 1075; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 49; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 34 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:9589604..9590846 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27024.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 244 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANHETIFDQ LKKQIPVDEE EPLILNRDSS VGLVIVDVVN GFCTIGSGNM APTKHNEQIS KMVEESAKLA REFCDRKWPV LAFIDSHHPD IPERPYPPHC 101: IIGTEESELV PALKWLESED CATLRRKDCI NGFVGSMESD GSNVFVDWVK EKQIKVIVVV GICTDICVFD FVATALSARN HGVLSPVEDV VVYSRGCATF 201: DLPLHVAKDI KGAQAHPQEL MHHVGLYMAK GRGAQVVSKI SFET |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)