AT2G04540.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Beta-ketoacyl synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Beta-ketoacyl synthase; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups, fatty acid synthase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: biosynthetic process, fatty acid biosynthetic process, metabolic process; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Beta-ketoacyl synthase (InterPro:IPR000794), Thiolase-like (InterPro:IPR016039), Beta-ketoacyl synthase, C-terminal (InterPro:IPR014031), 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2 (InterPro:IPR017568), Beta-ketoacyl synthase, N-terminal (InterPro:IPR014030), Thiolase-like, subgroup (InterPro:IPR016038), Beta-ketoacyl synthase, active site (InterPro:IPR018201); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 3-ketoacyl-acyl carrier protein synthase I (TAIR:AT5G46290.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:1581521..1584635 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49381.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 461 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSNLRRHL SASRLRLNRF ISTSSSYHSH RRVVVTGLGM VTPLGRGVET TWRRLIDGEC GIRGLTLDDL KMKSFDEETK LYTFDQLSSK VAAFVPYGSN 101: PGEFDEALWL NSKAVANFIG YAVCAADEAL RDAEWLPTEE EEKERTGVSI GGGIGSICDI VEAAQLICEK RLRRLSPFFI PKILVNMASG HVSMKYGFQG 201: PNHAAVTACA TGAHSIGDAT RMIQFGDADV MVAGGTESSI DALSVAGFSR SRALSTKFNS SPQEASRPFD CDRDGFVIGE GSGVIVLEEY EHAKRRGAKI 301: YAELCGYGMS GDAHHITQPP EDGKGAVLAM TRALRQSGLC PNQIDYVNAH ATSTPIGDAV EARAIKTVFS EHATSGTLAF SSTKGATGHL LGAAGAVEAI 401: FSILAIHHGV APMTLNVKNP DPIFDKRFMP LTTSKKMLVR TAMSNSFGFG GTNASLLFAS I |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)