AT1G80950.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: acyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: endoplasmic reticulum, nucleus; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcineurin B subunit-related (TAIR:AT2G45670.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:30412653..30414935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44715.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 398 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESELKDLNS NSNPPSSKED RPLLKSESDL AAAIEELDKK FAPYARTDLY GTMGLGPFPM TENIKLAVAL VTLVPLRFLL SMSILLLYYL ICRVFTLFSA 101: PYRGPEEEED EGGVVFQEDY AHMEGWKRTV IVRSGRFLSR VLLFVFGFYW IHESCPDRDS DMDSNPKTTS TEINQKGEAA TEEPERPGAI VSNHVSYLDI 201: LYHMSASFPS FVAKRSVGKL PLVGLISKCL GCVYVQREAK SPDFKGVSGT VNERVREAHS NKSAPTIMLF PEGTTTNGDY LLTFKTGAFL AGTPVLPVIL 301: KYPYERFSVA WDTISGARHI LFLLCQVVNH LEVIRLPVYY PSQEEKDDPK LYASNVRKLM ATEGNLILSE LGLSDKRIYH ATLNGNLSQT RDFHQKEE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)