AT1G76670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleotide-sugar transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Nucleotide-sugar transporter family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF250 (InterPro:IPR004853); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleotide-sugar transporter family protein (TAIR:AT1G21070.1); Has 1975 Blast hits to 1967 proteins in 210 species: Archae - 0; Bacteria - 20; Metazoa - 359; Fungi - 295; Plants - 1101; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 200 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28772890..28774569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37695.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 347 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKPESEKKS AVSDVGAWAM NVISSVGIIM ANKQLMSSSG FGFGFATTLT GFHFAFTALV GMVSNATGLS ASKHVPLWEL LWFSIVANIS IAAMNFSLML 101: NSVGFYQISK LSMIPVVCVL EWILHSKHYC KEVKASVMVV VIGVGICTVT DVKVNAKGFI CACTAVFSTS LQQISIGSLQ KKYSVGSFEL LSKTAPIQAI 201: SLLICGPFVD YLLSGKFIST YQMTYGAIFC ILLSCALAVF CNISQYLCIG RFSATSFQVL GHMKTVCVLT LGWLLFDSEM TFKNIAGMAI AIVGMVIYSW 301: AVDIEKQRNA KSTPHGKHSM TEDEIKLLKE GVEHIDLKDV ELGDTKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)