AT1G76340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : golgi nucleotide sugar transporter 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a nucleotide-sugar transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
golgi nucleotide sugar transporter 3 (GONST3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF250 (InterPro:IPR004853); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: golgi nucleotide sugar transporter 4 (TAIR:AT5G19980.1); Has 1377 Blast hits to 1372 proteins in 233 species: Archae - 0; Bacteria - 8; Metazoa - 324; Fungi - 246; Plants - 675; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 124 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28635188..28636306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41742.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 372 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTNDEENGT VIEVKNVPEP SPETWYSVFL RQASVYGVAA GYCLSASLLS IINKWAIMKF PYPGALTAMQ YFTSAAGVLL CAQMKLIEHD SLNLLTMWRF 101: LPAAMIFYLS LFTNSELLLH ANVDTFIVFR SAVPIFVAIG ETLFLHQPWP SVKTWGSLAT IFGGSLLYVF TDYQFTIAAY SWALAYLVSM TIDFVYIKHV 201: VMTIGLNTWG LVLYNNLEAL LLFPLELLIM GELKKIKHEI TDETDWYSLQ VVLPVGLSCL FGLAISFFGF SCRRAISATG FTVLGIVNKL LTVVINLMVW 301: DKHSTFVGTL GLLVCMFGGV MYQQSTIKKP NATQEAKPQE QDEEQEKLLE MQENKESNSV DIKETLKSEE KL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)