AT1G75200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flavodoxin family protein / radical SAM domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
flavodoxin family protein / radical SAM domain-containing protein; FUNCTIONS IN: iron-sulfur cluster binding, oxidoreductase activity, FMN binding, catalytic activity; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Flavodoxin/nitric oxide synthase (InterPro:IPR008254), Radical SAM (InterPro:IPR007197), Wyosine base formation (InterPro:IPR013917); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P450 reductase 2 (TAIR:AT4G30210.2); Has 3108 Blast hits to 3089 proteins in 883 species: Archae - 191; Bacteria - 976; Metazoa - 668; Fungi - 593; Plants - 205; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 475 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28220849..28223597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72083.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 647 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTTSSVRVR LAFVALLSAT TFYCIHKYRR LKHLKNLSLN PSSTLKASRG KIFFISQTGT AKALAQRLHE LCASNDIAFD IVDPHSYEPE DLPKETLVLF 101: IASTWDGGKP PKNGEFLVNW LGESAEDFRV GSLLLSDCKF AVFGVGSRAY GESYNAVAKE LSSRMIGLGG LEMIPVGEGD VDDGELDRAF QDWCDGVIRV 201: LKGGSAQETN GVSQQIGAVE DDLEYYDSTD EEDEDNDADG GIVDLEDIAG KAPSKRNGVV KVTKVDGKKE MVTPVIRASL TKQGYKIIGS HSGVKICRWT 301: KSQLRGRGGC YKHSFYGIES HRCMETTPSL ACANKCVFCW RHHTNPVGKS WQWKMDEPSV IVKGALDLHK NMIKQMKGVP GVTPEKLQEG LNPRHCALSL 401: VGEPIMYPEI NALVDELHGR RISTFLVTNA QFPEKILMMK PITQLYVSVD AATKESLKAI DRPLFADFWE RFIDSLKALQ EKQQRTVYRL TLVKGWNTEE 501: LDAYFNLFSI GKPDFIEIKG VTYCGSSATS KLTMENVPWH TDVKAFSEAL SLKSNGEYEV ACEHAHSCCV LLGRTEKFKV DGKWFTWIDY EKFHDLVASG 601: EPFTSTDYMA QTPSWAVYGA QEGGFDPGQL RYKKERNHPP KPQAVLA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)