AT1G74320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a choline kinase, whose expression is induced by high salt and mannitol. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Choline/ethanolamine kinase (InterPro:IPR002573), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT4G09760.1); Has 1486 Blast hits to 1432 proteins in 373 species: Archae - 0; Bacteria - 346; Metazoa - 438; Fungi - 245; Plants - 167; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 290 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27941192..27942903 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41019.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 350 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTMGGTEKNV ENKQYRLPRE VKEALQAIAS EWEDVIDSKA LQVIPLKGAM TNEVFQIKWP TREKGPSRKV LVRIYGEGVE IFFDREDEIR TFEFMSKHGH 101: GPLLLGRFGN GRIEEFLHAR TLSACDLRDP EISGRIATRM KEFHGLEMPG AKKALLWDRL RNWLTACKRL ASPEEAKSFR LDVMEMEINM LEKSLFDNDE 201: NIGFCHNDLQ YGNIMMDEET KAITIIDYEY SCYNPVAYDI ANHFCEMAAD YHTETPHIMD YSKYPGVEER QRFLKTYMSY SDEKPSDTMV KKLLEDVEKY 301: TLASHLIWGL WGIISEHVNE IDFDYMEYAR QRFEQYWLTK PRLLAASEHK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)