AT1G70130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.954 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: hypocotyl, male gametophyte, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein (TAIR:AT4G29050.1); Has 123019 Blast hits to 121562 proteins in 4869 species: Archae - 114; Bacteria - 14453; Metazoa - 44718; Fungi - 10905; Plants - 34151; Viruses - 442; Other Eukaryotes - 18236 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26409743..26411801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72459.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 656 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLLLKMLLF SLFFFYMASI SQCSDPTGGQ FSFNGYLYTD GVADLNPDGL FKLITSKTQG GAGQVLYQFP LQFKNSPNGT VSSFSTTFVF AIVAVRKTIA 101: GCGLSFNISP TKGLNSVPNI DHSNHSVSVG FHTAKSDKPD GEDVNLVGIN IDSSKMDRNC SAGYYKDDGR LVNLDIASGK PIQVWIEYNN STKQLDVTMH 201: SIKISKPKIP LLSMRKDLSP YLHEYMYIGF TSVGSPTSSH YILGWSFNNK GAVSDINLSR LPKVPDEDQE RSLSSKILAI SLSISGVTLV IVLILGVMLF 301: LKRKKFLEVI EDWEVQFGPH KFTYKDLFIA TKGFKNSEVL GKGGFGKVFK GILPLSSIPI AVKKISHDSR QGMREFLAEI ATIGRLRHPD LVRLLGYCRR 401: KGELYLVYDF MPKGSLDKFL YNQPNQILDW SQRFNIIKDV ASGLCYLHQQ WVQVIIHRDI KPANILLDEN MNAKLGDFGL AKLCDHGIDS QTSNVAGTFG 501: YISPELSRTG KSSTSSDVFA FGVFMLEITC GRRPIGPRGS PSEMVLTDWV LDCWDSGDIL QVVDEKLGHR YLAEQVTLVL KLGLLCSHPV AATRPSMSSV 601: IQFLDGVATL PHNLLDLVNS RIINEGFDTL GVTTESMEAS SNVSLVMTES FLSSGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)