AT1G67070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mannose-6-phosphate isomerase, type I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with phosphomannose isomerase activity that is involved in synthesis of ascorbic acid. Expression is induced after 24 hours of dark treatment, in senescing leaves and treatment with exogenous photosynthesis inhibitor. Induction of gene expression was suppressed in excised leaves supplied with sugar. The authors suggest that the gene's expression pattern is responding to the level of sugar in the cell. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DARK INDUCIBLE 9 (DIN9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mannose-6-phosphate isomerase (InterPro:IPR016305), Cupin, RmlC-type (InterPro:IPR011051), Mannose-6-phosphate isomerase, type I (InterPro:IPR001250), RmlC-like jelly roll fold (InterPro:IPR014710), Phosphomannose isomerase, type I, conserved site (InterPro:IPR018050); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mannose-6-phosphate isomerase, type I (TAIR:AT3G02570.1); Has 2340 Blast hits to 2321 proteins in 789 species: Archae - 2; Bacteria - 1171; Metazoa - 570; Fungi - 215; Plants - 90; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 292 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:25042324..25044412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49251.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 441 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGADAIQTNG HDQAKLTGGE EIQRLRCFVK NYEWGKLGPE SLVARLQEAN TGQRVDSEIP YAEFWMGTHE SGPSHVEFGS GHGVSDKCMV TLKSWVLDNP 101: NLLGSKVVDK WGCDLPFLFK VLSVTKALSI QAHPNKALAE KLHREDPLLY RDNNHKPEIA LAVTPFQALC GFVTLKELKE VITNVPEITE LVGSKAADQI 201: FNVHEHDEDE RIKSVVRLIF TQLMSASNNE TKQVVSRMKN RLLLETKHRE LSEKEKLVLE LEKQYTGDIG VISAFFFNYV KLNPGEALYL DANEPHAYIS 301: GDCVECMAAS DNVVRAGLTP KHRDVQTLCS MLTYKLGYPE ILKGFPLTPY VTRYLPPFDE FEVDHCDLPR GKSTVFPAVP GPSVYLVIEG KGQLRTGSSK 401: VLVNRGDVLF VPADIEIHVT GESDVMKLYR AGVSSRFFQT L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)