AT1G66200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutamine synthase clone F11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a cytosolic glutamate synthetase, this enzyme has low affinity with substrate ammonium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutamine synthase clone F11 (GSR2); FUNCTIONS IN: glutamate-ammonia ligase activity, copper ion binding; INVOLVED IN: nitrate assimilation, response to fructose stimulus, response to salt stress, response to sucrose stimulus, response to glucose stimulus; LOCATED IN: cytosol, cytosolic ribosome, apoplast, vacuole, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutamine synthetase, catalytic domain (InterPro:IPR008146), Glutamine synthetase, beta-Grasp (InterPro:IPR008147), Glutamine synthetase/guanido kinase, catalytic domain (InterPro:IPR014746); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutamine synthase clone R1 (TAIR:AT5G37600.1); Has 11094 Blast hits to 11090 proteins in 3405 species: Archae - 162; Bacteria - 5924; Metazoa - 440; Fungi - 257; Plants - 1757; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2551 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24655520..24657520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39209.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 356 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLLADLVNL DISDNSEKII AEYIWVGGSG MDMRSKARTL PGPVTDPSKL PKWNYDGSST GQAPGQDSEV ILYPQAIFKD PFRRGNNILV MCDAYTPAGE 101: PIPTNKRHAA AEIFANPDVI AEVPWYGIEQ EYTLLQKDVN WPLGWPIGGF PGPQGPYYCS IGADKSFGRD IVDAHYKASL YAGINISGIN GEVMPGQWEF 201: QVGPSVGISA ADEIWIARYI LERITEIAGV VVSFDPKPIP GDWNGAGAHT NYSTKSMREE GGYEIIKKAI EKLGLRHKEH ISAYGEGNER RLTGHHETAD 301: INTFLWGVAN RGASIRVGRD TEKEGKGYFE DRRPASNMDP YVVTSMIAET TLLWNP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)