AT1G59960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity; INVOLVED IN: response to salt stress; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldo/keto reductase (InterPro:IPR001395), Aldo/keto reductase subgroup (InterPro:IPR020471), Aldo/keto reductase, conserved site (InterPro:IPR018170); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein (TAIR:AT1G59950.1); Has 18939 Blast hits to 18918 proteins in 2314 species: Archae - 331; Bacteria - 12289; Metazoa - 1736; Fungi - 1658; Plants - 1296; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1629 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22071410..22073067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36732.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 326 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLTTVPTLA IRSGPSGHHS MPVLGFGTAA SPLPEPTMLK ETVIEAIKLG YRHFDTSPRY QTEEPIGEAL AEAVSLGLVR SRSEFFVTTK LWCADAHGGL 101: VVPAIKRSLK NLKLDYLDLY IIHWPVSSKP GKYKFPIDED DFMPMDFEVV WSEMEECQRL GLAKCIGVSN FSCKKLQHIL SIATIPPSVN QVEMSPIWQQ 201: RKLRELCRSN DIVVTAYSVL GSRGAFWGTP KIMESDVLKE IAEAKEKTVA QVSMRWAYEQ GVSMVVKSFT KERLEENLKI FDWSLTEDET QRISTEIPQF 301: RNVHGEVYTS KKGPIKSVAE MWDGEI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)