AT1G54650.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.585 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Methyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Methyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Methyltransferase, METTL2, predicted (InterPro:IPR017280), Methyltransferase type 12 (InterPro:IPR013217); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT2G26200.1); Has 670 Blast hits to 664 proteins in 213 species: Archae - 10; Bacteria - 13; Metazoa - 325; Fungi - 137; Plants - 84; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 101 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:20405813..20407686 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34627.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 299 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKREEAGEY HSKDFEWEFL KNIVENDPSL SHHLHHHHQN LSKYLPDSQP WQDFHSRHSS GKFFKERRYL LKEFPELVSC GENSKLLEIG CGNGSTVLPI 101: LRGSKNITVY ACDCSSDALV RTKENIDRAI SSVDNFHSFC CDFSTSEFPD WVACDRCRDK FMLNHSGGSE SKHCIGGVDF VTLIFTLSAV PKERMPRAIK 201: ECFAVLKPGG LLLFRDYGLY DMTMLRFEPE KRVGFREYVR SDGTLSYFFC LDTARKLFTD AGFIEVELEY CCVKAVNRRK GKDMYRVWVH GKFQKPFSN |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)