AT1G49710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fucosyltransferase 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with core α1,3-fucosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fucosyltransferase 12 (FUT12); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups, fucosyltransferase activity; INVOLVED IN: protein amino acid glycosylation; LOCATED IN: Golgi apparatus; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 10 (InterPro:IPR001503); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fucosyltransferase 11 (TAIR:AT3G19280.1); Has 1527 Blast hits to 1523 proteins in 197 species: Archae - 4; Bacteria - 161; Metazoa - 1008; Fungi - 0; Plants - 130; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 221 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:18391622..18393769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57311.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 513 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGVFSNLRGP RAGATHDEFP ATNGSPSSSS SPSSSIKRKL SNLLPLCVAL VVIAEIGFLG RLDKVALVDT LTDFFTQSPS LSQSPPARSD RKKIGLFTDR 101: SCEEWLMRED SVTYSRDFTK DPIFISGGEK DFQWCSVDCT FGDSSGKTPD AAFGLGQKPG TLSIIRSMES AQYYPENDLA QARRRGYDIV MTTSLSSDVP 201: VGYFSWAEYD IMSPVQPKTE RAIAAAFISN CGARNFRLQA LEALMKTNIK IDSYGGCHRN RDGKVDKVEA LKRYKFSLAF ENTNEEDYVT EKFFQSLVAG 301: SVPVVVGPPN IEEFAPASDS FLHIKTMEDV EPVAKRMKYL AANPAAYNQT LRWKYEGPSD SFKALVDMAA VHSSCRLCIF LATRVREQEE ESPNFKKRPC 401: KCSRGGSDTV YHVFVRERGR FEMESVFLRG KSVTQEALES AVLAKFKSLK HEAVWKKERP GNLKGDKELK IHRIYPLGLT QRQALYNFKF EGNSSLSSHI 501: QNNPCAKFEV VFV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)