AT1G32200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phospholipid/glycerol acyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a chloroplast glycerol-3-phosphate acyltransferase.Involved in the biosynthesis of chloroplast phosphatidylglycerol. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATS1; FUNCTIONS IN: glycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity; INVOLVED IN: phosphatidylglycerol biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast, plastid; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123), Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase (InterPro:IPR016222); Has 391 Blast hits to 391 proteins in 121 species: Archae - 0; Bacteria - 73; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 291; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 27 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:11602223..11605001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50423.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 459 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTLTFSSSAA TVAVAAATVT SSARVPVYPL ASSTLRGLVS FRLTAKKLFL PPLRSRGGVS VRAMSELVQD KESSVAASIA FNEAAGETPS ELSHSRTFLD 101: ARSEQDLLSG IKKEAEAGRL PANVAAGMEE LYWNYKNAVL SSGASRADET VVSNMSVAFD RMLLGVEDPY TFNPYHKAVR EPFDYYMFVH TYIRPLIDFK 201: NSYVGNASIF SELEDKIRQG HNIVLISNHQ SEADPAVISL LLEAQSPFIG ENIKCVAGDR VITDPLCKPF SMGRNLICVY SKKHMNDDPE LVDMKRKANT 301: RSLKEMATML RSGGQLIWIA PSGGRDRPNP STGEWFPAPF DASSVDNMRR LVEHSGAPGH IYPMSLLCYD IMPPPPQVEK EIGEKRLVGF HGTGLSIAPE 401: INFSDVTADC ESPNEAKEAY SQALYKSVNE QYEILNSAIK HRRGVEASTS RVSLSQPWN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)