AT2G25840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleotidylyl transferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ovule abortion 4 (OVA4); FUNCTIONS IN: nucleotide binding, aminoacyl-tRNA ligase activity, tryptophan-tRNA ligase activity, ATP binding; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation, tRNA aminoacylation for protein translation, ovule development; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site (InterPro:IPR001412), Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Tryptophanyl-tRNA synthetase, class Ib (InterPro:IPR002306), Aminoacyl-tRNA synthetase, class Ib (InterPro:IPR002305); Has 9074 Blast hits to 9053 proteins in 2715 species: Archae - 101; Bacteria - 5434; Metazoa - 147; Fungi - 137; Plants - 44; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3211 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11021924..11025158 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45302.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 408 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGHATSLSHF LILSSSRFSR LGSLTRLLSK PTSLSGSFSS ISVTGQGFRC CCSVATDDTS PSVKKRVVSG VQPTGSVHLG NYLGAIKNWV ALQDTYETLF 101: IIVDHHAITL PYDTRQLGKA TTDTAALYLA CGIDVSKASV FVQSHVPAHV ELMWLLCSST PIGWLQKMIQ FKEKSRKEGV ENASVGLFTY PDLMTADILL 201: YQSDFVPVGE DQKQHIELAR EIAQRVNHLY GGKKWKKLGG RGGSLFKIPE PLIPQAGARV MSLTDGLSKM SKSAPSDQSR INLLDSKDLI VDKIKRCKTD 301: SFAGLEFDNA ERPECNNLLS IYQIVSGKKK EEVMEECKDM SWGTFKPLLA DALIEHLSPI QARYQEIIAE PEYLDKILSE GADRAEELGA VTMRNMYQAM 401: GYYQRRRY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)