AT1G31930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : extra-large GTP-binding protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes XLG3 (extra-large G protein 3) that shows significant similarity to the G protein alpha subunit in its C terminal region. Involved in the regulation of root morphological and growth responses. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
extra-large GTP-binding protein 3 (XLG3); FUNCTIONS IN: guanyl nucleotide binding, signal transducer activity; INVOLVED IN: in 11 processes; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit (InterPro:IPR001019), G protein alpha subunit, helical insertion (InterPro:IPR011025); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: extra-large G-protein 1 (TAIR:AT2G23460.1); Has 3436 Blast hits to 3429 proteins in 399 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 2221; Fungi - 595; Plants - 371; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 247 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:11465832..11468961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 96176.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 848 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKKDEGESW KEMVRKMLPP GAPLPEDPSE FDYSIALEYT GPPPVHDIPR VSPVDVNPRV NNPIPLPVSR IAGGVTSSSG GSPASSESVV SVLHNNPESS 101: SGSASVSPVS GHRQNGNQVR RPVVKFKPVD DHDRIEGREA AEEEDNNVEA ETERERKVHE CTASTKRRKK KKKSECYRCG KAKWENKETC IVCDEKYCGN 201: CVLRAMGSMP EGRKCVSCIG QAIDESKRSK LGKHSRVLSR LLSPLEVKQI MKAEKECTAN QLRPEQLIVN GYPLKPEEMA DLLNCLLPPQ KLKPGRYWYD 301: KESGLWGKEG EKPDRVISSN LNFTGKLSPD ASNGNTEVYI NGREITKLEL RILKLANVQC PRDTHFWVYD DGRYEEEGQN NIRGNIWEKA STRFMCALFS 401: LPVPQGQPRG TVQPSSNYAT VPNYIEHKKI QKLLLLGIEG SGTSTIFKQA KFLYGNKFSV EELQDIKLMV QSNMYRYLSI LLDGRERFEE EALSHTRGLN 501: AVEGDSGGEE ANDEGTVTTP QSVYTLNPRL KHFSDWLLDI IATGDLDAFF PAATREYAPL VEEVWKDPAI QATYRRKDEL HFLPDVAEYF LSRAMEVSSN 601: EYEPSERDIV YAEGVTQGNG LAFMEFSLSD HSPMSESYPE NPDALSSPQP KYQLIRVNAK GMNDSCKWVE MFEDVRAVIF CISLSDYDQI NITPESSGTV 701: QYQNKMIQSK ELFESMVKHP CFKDTPFILI LNKYDQFEEK LNRAPLTSCD WFSDFCPVRT NNNVQSLAYQ AYFYVAMKFK LLYFSITGQK LFVWQARARD 801: RANVDEGFKY VREVLKWDEE KEESYLNGGG EDSFYSTDMS SSPYRPEE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)