AT1G31190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myo-inositol monophosphatase like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a myo-inositol monophosphatase IMPL1 (myo-Inositol monophosphatase like 1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
myo-inositol monophosphatase like 1 (IMPL1); FUNCTIONS IN: 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase activity, inositol or phosphatidylinositol phosphatase activity, inositol-1(or 4)-monophosphatase activity; INVOLVED IN: sulfur metabolic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast stroma; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inositol monophosphatase, conserved site (InterPro:IPR020550), Inositol monophosphatase (InterPro:IPR000760), Inositol monophosphatase, metal-binding site (InterPro:IPR020583); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Inositol monophosphatase family protein (TAIR:AT3G02870.3); Has 14949 Blast hits to 14933 proteins in 2333 species: Archae - 246; Bacteria - 8365; Metazoa - 464; Fungi - 305; Plants - 295; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5274 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:11144861..11146800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40447.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 371 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRSLIFSGN MSLRISHLPR SSLPLQNPIS GRTVNRTFRY RCTRILSNSF KSTTRLQTKA VLSEVSDQTR YPRIGAKTTG TISPAHLLEV VELAAKTGAE 101: VVMEAVNKPR NITYKGLSDL VTDTDKASEA AILEVVKKNF SDHLILGEEG GIIGDSSSDY LWCIDPLDGT TNFAHGYPSF AVSVGVLYRG NPAAASVVEF 201: VGGPMCWNTR TFSATAGGGA LCNGQKIHVS KTDAVERALL ITGFGYEHDD AWSTNMELFK EFTDVSRGVR RLGAAAVDMC HVALGIAESY WEYRLKPWDM 301: AAGVLIVEEA GGAVTRMDGG KFSVFDRSVL VSNGVLHPKL LERIAPATEN LKSKGIDFSL WFKPEDYHTE L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)