AT3G24430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a MRP-like protein with a nucleotide-binding domain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
HIGH-CHLOROPHYLL-FLUORESCENCE 101 (HCF101); FUNCTIONS IN: ATP binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mrp, conserved site (InterPro:IPR000808), Gamma-butyrobetaine dioxygenase/Trimethyllysine dioxygenase, N-terminal (InterPro:IPR010376), Protein of unknown function DUF59 (InterPro:IPR002744), ATPase-like, ParA/MinD (InterPro:IPR019591); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: IND1(iron-sulfur protein required for NADH dehydrogenase)-like (TAIR:AT4G19540.1); Has 16372 Blast hits to 16340 proteins in 2775 species: Archae - 600; Bacteria - 10162; Metazoa - 436; Fungi - 428; Plants - 202; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4544 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:8868731..8872154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57767.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 532 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPLLHPQSLR HPSFEIQTQR RSNSTTRLLL SHKFLHSQAS IISISRTRIL KRVSQNLSVA KAASAQASSS VGESVAQTSE KDVLKALSQI IDPDFGTDIV 101: SCGFVKDLGI NEALGEVSFR LELTTPACPV KDMFENKANE VVAALPWVKK VNVTMSAQPA KPIFAGQLPF GLSRISNIIA VSSCKGGVGK STVAVNLAYT 201: LAGMGARVGI FDADVYGPSL PTMVNPESRI LEMNPEKKTI IPTEYMGVKL VSFGFAGQGR AIMRGPMVSG VINQLLTTTE WGELDYLVID MPPGTGDIQL 301: TLCQVAPLTA AVIVTTPQKL AFIDVAKGVR MFSKLKVPCV AVVENMCHFD ADGKRYYPFG KGSGSEVVKQ FGIPHLFDLP IRPTLSASGD SGTPEVVSDP 401: LSDVARTFQD LGVCVVQQCA KIRQQVSTAV TYDKYLKAIR VKVPNSDEEF LLHPATVRRN DRSAQSVDEW TGEQKVLYGD VAEDIEPEDI RPMGNYAVSI 501: TWPDGFSQIA PYDQLEEIER LVDVPPLSPV EV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)