AT2G01110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Sec-independent periplasmic protein translocase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
mutant is Albino and pale green; Chloroplast Protein Translocation (tatC). Core subunit of the chloroplast Tat translocase. Integral chloroplast thylakoid membrane protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ALBINO AND PALE GREEN 2 (APG2); FUNCTIONS IN: proton motive force dependent protein transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: thylakoid membrane organization, double fertilization forming a zygote and endosperm; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, receptor complex, chloroplast, integral to thylakoid membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sec-independent periplasmic protein translocase (InterPro:IPR002033), Sec-independent periplasmic protein translocase, conserved site (InterPro:IPR019820), Twin arginine-targeting protein translocase, TatC (InterPro:IPR019822); Has 5953 Blast hits to 5918 proteins in 1859 species: Archae - 177; Bacteria - 3492; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 81; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2203 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:83786..85088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37369.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 340 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSTSTSSAL IHHFRLTTRN LGSPTKQRCP YAVTFCNSWR EAGLRYSVTQ RRSKGFGPVS ALNDDDSPTE TTPGVGSAVE DRPPDSSEDR SSSVYEFLYP 101: RKEELPDDKE MTIFDHLEEL RERIFVSVLA VGAAILGCFA FSKDLIVFLE APVKTQGVRF LQLAPGEFFF TTLKVSGYCG LLLGSPVILY EIIAFVLPGL 201: TRAERRFLGP IVFGSSLLFY AGLAFSYWVL TPAALNFFVN YAEGVVESLW SIDQYFEFVL VLMFSTGLSF QVPVIQLLLG QVGVVSGDQM LSIWRYVVVG 301: AVVAAAVVTP STDPVTQMLL ATPLLGLYLG GAWMVKLTGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)