AT1G28330.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : dormancy-associated protein-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
dormancy-associated protein (DRM1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
dormancy-associated protein-like 1 (DYL1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dormancyauxin associated (InterPro:IPR008406); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dormancy/auxin associated family protein (TAIR:AT2G33830.2); Has 226 Blast hits to 226 proteins in 49 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 225; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:9934252..9935216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 13406.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 122 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVLLEKLWDD VVAGPQPDRG LGRLRKITTQ PINIRDIGEG SSSKVVMHRS LTMPAAVSPG TPTTPTTPTT PRKDNVWRSV FNPGSNLATR AIGSNIFDKP 101: THPNSPSVYD WLYSGDSRSQ HR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)