AT1G27120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.857 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Galactosyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Galactosyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: protein amino acid glycosylation; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Galectin, carbohydrate recognition domain (InterPro:IPR001079), Glycosyl transferase, family 31 (InterPro:IPR002659), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Galactosyltransferase family protein (TAIR:AT5G62620.1); Has 2356 Blast hits to 2323 proteins in 111 species: Archae - 0; Bacteria - 6; Metazoa - 1677; Fungi - 2; Plants - 620; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 51 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:9421389..9423910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 77041.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 673 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKKSKLDNSS SQIRFGLVQF LLVVLLFYFL CMSFEIPFIF RTGSGSGSDD VSSSSFADAL PRPMVVGGGS REANWVVGEE EEADPHRHFK DPGRVQLRLP 101: ERKMREFKSV SEIFVNESFF DNGGFSDEFS IFHKTAKHAI SMGRKMWDGL DSGLIKPDKA PVKTRIEKCP DMVSVSESEF VNRSRILVLP CGLTLGSHIT 201: VVATPHWAHV EKDGDKTAMV SQFMMELQGL KAVDGEDPPR ILHFNPRIKG DWSGRPVIEQ NTCYRMQWGS GLRCDGRESS DDEEYVDGEV KCERWKRDDD 301: DGGNNGDDFD ESKKTWWLNR LMGRRKKMIT HDWDYPFAEG KLFVLTLRAG MEGYHISVNG RHITSFPYRT GFVLEDATGL AVKGNIDVHS VYAASLPSTN 401: PSFAPQKHLE MQRIWKAPSL PQKPVELFIG ILSAGNHFAE RMAVRKSWMQ QKLVRSSKVV ARFFVALHAR KEVNVDLKKE AEYFGDIVIV PYMDHYDLVV 501: LKTVAICEYG VNTVAAKYVM KCDDDTFVRV DAVIQEAEKV KGRESLYIGN INFNHKPLRT GKWAVTFEEW PEEYYPPYAN GPGYILSYDV AKFIVDDFEQ 601: KRLRLFKMED VSMGMWVEKF NETRPVAVVH SLKFCQFGCI EDYFTAHYQS PRQMICMWDK LQRLGKPQCC NMR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)