AT1G26090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; LOCATED IN: chloroplast, plastoglobule; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; Has 1161 Blast hits to 1150 proteins in 416 species: Archae - 94; Bacteria - 665; Metazoa - 113; Fungi - 156; Plants - 46; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 87 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:9020509..9022619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49911.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 455 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSLVNSSLT CSSLTLNLLP ILRTETPSLS RKRRAAYVAA TSSRDVNDTA ADSSQKLTKF VTFLGKGGSG KTTAAVFAAQ HYALAGLSTC LVIHNQDPSA 101: EFLLGSKIGT SPTLINDNLS VIRLETTKML LEPLKQLKQA DARLNMTQGV LEGVVGEELG VLPGMDSIFS MLELERLVGF FRQATRKNHK GKPFDVIIYD 201: GISTEETLRM IGLSSKTRLY AKYLRSLAEK TDLGRLTSPS IMRFVDESMN INSNKSPFDG MTSPAMWDTL ERFLETGASA WRDPERFRSF LVMDPNNPMS 301: VKAALRYWGC TVQAGSHVSG AFAISSSHLT SQIPKADFVP LPFASASVPF TITGLDWDKI LLDQANSSIR ELLSETVSHG TSLTQTVMFD TAKKLVTLFM 401: PGFEKSEIKL YQYRGGSELL IEAGDQRRVI HLPSQIQGKV GGAKFVDRSL IVTMR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)