AT1G73990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : signal peptide peptidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative protease SppA (SppA). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
signal peptide peptidase (SPPA); FUNCTIONS IN: serine-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, response to light intensity; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S49, protease IV (InterPro:IPR004634), Peptidase S49 (InterPro:IPR002142), Peptidase S49, SppA (InterPro:IPR004635); Has 9340 Blast hits to 7649 proteins in 1706 species: Archae - 204; Bacteria - 6183; Metazoa - 9; Fungi - 4; Plants - 52; Viruses - 43; Other Eukaryotes - 2845 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27824465..27828807 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 75098.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 677 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKLLLLHAP HVIPRFSSSS SRSLVSAAAL YRRPLLVNPQ FSHIGPRLHS PYNRRFSARA FDDSPASSAE MEKEKQEQLL DGVSGKKDED YPTGEMEYEN 101: RNAWEIFVVK FRMLFAYPWQ RVRKGSVLTM TLRGQISDQL KSRFNSGLSL PQLSENFVKA AYDPRIAGVY LHIDPLSCGW GKVEEIRRHI LNFKKSGKFI 201: VGYISICGLK EYYLGCACNE LFAPPSAYSF LYGLTVQASF LGGVFEKVGI EPQVQRIGKY KSAGDQLSRK SISEENYEML SVLLDNIYSN WLDGVSDATG 301: KKREDVENFI NQGVYEIEKL KEAGLIKDIR YDDEVITMLK ERLGVEKDKK LPTVDYKKYS GVKKWTLGLT GGRDQIAIIR AGGSISRVKG PLSTPGSAII 401: AEQLIEKIRS VRESKKYKAA IIRIDSPGGD ALASDLMWRE IKLLAETKPV IASMSDVAAS GGYYMAMAAN AIVAENLTLT GSIGVVTARF TLAKLYEKIG 501: FNKETISRGK YAELLGAEER PLKPEEAELF EKSAQHAYQL FRDKAALSRS MPVDKMEEVA QGRVWTGKDA HSRGLIDAVG GLSRAIAIAK QKANIPLNKK 601: VTLVELSRPS TSLPDILSGI GSSVIGVDRT LKGLLDELTI TEGVQARMDG IMFQQLGRDS LATPIIDMLK DYLSSLR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)