AT1G22400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.542 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UGT85A1; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glucosyl transferase 85A3 (TAIR:AT1G22380.1); Has 7940 Blast hits to 7832 proteins in 421 species: Archae - 0; Bacteria - 227; Metazoa - 2330; Fungi - 36; Plants - 5216; Viruses - 60; Other Eukaryotes - 71 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:7903851..7906607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55013.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 489 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSQIIHNSQ KPHVVCVPYP AQGHINPMMR VAKLLHARGF YVTFVNTVYN HNRFLRSRGS NALDGLPSFR FESIADGLPE TDMDATQDIT ALCESTMKNC 101: LAPFRELLQR INAGDNVPPV SCIVSDGCMS FTLDVAEELG VPEVLFWTTS GCAFLAYLHF YLFIEKGLCP LKDESYLTKE YLEDTVIDFI PTMKNVKLKD 201: IPSFIRTTNP DDVMISFALR ETERAKRASA IILNTFDDLE HDVVHAMQSI LPPVYSVGPL HLLANREIEE GSEIGMMSSN LWKEEMECLD WLDTKTQNSV 301: IYINFGSITV LSVKQLVEFA WGLAGSGKEF LWVIRPDLVA GEEAMVPPDF LMETKDRSML ASWCPQEKVL SHPAIGGFLT HCGWNSILES LSCGVPMVCW 401: PFFADQQMNC KFCCDEWDVG IEIGGDVKRE EVEAVVRELM DGEKGKKMRE KAVEWQRLAE KATEHKLGSS VMNFETVVSK FLLGQKSQD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)