AT1G22360.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 0.721 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 85A2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 85A2 (UGT85A2); FUNCTIONS IN: UDP-glycosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups, glucuronosyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT1G22400.1); Has 7750 Blast hits to 7637 proteins in 383 species: Archae - 0; Bacteria - 124; Metazoa - 2215; Fungi - 30; Plants - 5218; Viruses - 99; Other Eukaryotes - 64 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coordinates (TAIR10) | chr1:-:7895068..7897527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 54367.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 481 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSHVAQKQH VVCVPYPAQG HINPMMKVAK LLYAKGFHIT FVNTVYNHNR LLRSRGPNAV DGLPSFRFES IPDGLPETDV DVTQDIPTLC ESTMKHCLAP 101: FKELLRQINA RDDVPPVSCI VSDGCMSFTL DAAEELGVPE VLFWTTSACG FLAYLYYYRF IEKGLSPIKD ESYLTKEHLD TKIDWIPSMK NLRLKDIPSF 201: IRTTNPDDIM LNFIIREADR AKRASAIILN TFDDLEHDVI QSMKSIVPPV YSIGPLHLLE KQESGEYSEI GRTGSNLWRE ETECLDWLNT KARNSVVYVN 301: FGSITVLSAK QLVEFAWGLA ATGKEFLWVI RPDLVAGDEA MVPPEFLTAT ADRRMLASWC PQEKVLSHPA IGGFLTHCGW NSTLESLCGG VPMVCWPFFA 401: EQQTNCKFSR DEWEVGIEIG GDVKREEVEA VVRELMDEEK GKNMREKAEE WRRLANEATE HKHGSSKLNF EMLVNKVLLG E |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
See Also |
|
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)