AT1G18390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT1G66880.1); Has 21064 Blast hits to 20752 proteins in 1151 species: Archae - 24; Bacteria - 3918; Metazoa - 5271; Fungi - 1719; Plants - 7999; Viruses - 19; Other Eukaryotes - 2114 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6325876..6329935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72359.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 648 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSIFFFFISF VVFSVADLPS CFSADQQYEE CRSRNLTCGS GHRVFESTTY PFWGGFNKPK FCGHSSFKLS CEGDQNLTLA IGNITLRVVS ANLEDHKISV 101: ADDSLLDGGC LNIWNFNGKN QFTLDSNTET IDVFVNCSGV APLQISCEES YEDPVTYHVL RSSDSDEGCM KYAEIPMLRS AKDELQRSEL TFVEALRKGF 201: DLRYIMEDKA CRRCIDSGGI CGSALDSESF RCLCADRPHN SSCDDNTNQG KNDKRRRVIV KVLIGASAAV VGLIAASIFW YVYHRRKTKS YRNSSALLPR 301: NISSDPSAKS FDIEKAEELL VGVHIFSYEE LEEATNNFDP SKELGDGGFG TVYYGKLKDG RSVAVKRLYD NNFKRAEQFR NEVEILTGLR HPNLVALFGC 401: SSKQSRDLLL VYEYVANGTL ADHLHGPQAN PSSLPWSIRL KIAVETASAL KYLHASKIIH RDVKSNNILL DQNFNVKVAD FGLSRLFPMD KTHVSTAPQG 501: TPGYVDPDYH LCYQLSNKSD VYSFAVVLME LISSLPAVDI TRPRQEINLS NMAVVKIQNH ELRDMVDPSL GFDTDTRVRQ TVIAVAELAF QCLQSDKDLR 601: PCMSHVQDTL TRIQNNGFGS EMDVVDVNKS GPLVAQSPDS VIVKWDSK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)