AT1G14730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.739 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family; LOCATED IN: endomembrane system, integral to membrane; EXPRESSED IN: 16 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b561, eukaryote (InterPro:IPR004877), Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane (InterPro:IPR006593); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family (TAIR:AT4G25570.1); Has 599 Blast hits to 596 proteins in 97 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 368; Fungi - 6; Plants - 197; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 28 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5073244..5074568 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24783.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 224 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNLSGDRTTL KRHSSLSTLV AHFFGILAVV LMLIWLLHYR EGIEYGSDNP LKVLNVHPFL MYCGFLFLVG QAMMTYKTAY ASHQVQKMVH GGLHLIGLVL 101: GIVGICAAFR FHDKVNLKDM VSLHSWIGLT TFILLGVQWL FGAFTFLAPQ SSSGTRTRMM PWHVLGGRAL LYMGIVAALT GLMQRATMLG QSTNAESRLI 201: NFLGLAILLF GVSVDFSVAL GRYN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)