AT1G08110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lactoylglutathione lyase family protein / glyoxalase I family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
lactoylglutathione lyase family protein / glyoxalase I family protein; FUNCTIONS IN: calmodulin binding, lactoylglutathione lyase activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glyoxalase I (InterPro:IPR004361), Glyoxalase I, conserved site (InterPro:IPR018146), Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase (InterPro:IPR004360); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily protein (TAIR:AT1G67280.1); Has 4789 Blast hits to 4500 proteins in 1507 species: Archae - 34; Bacteria - 2875; Metazoa - 164; Fungi - 363; Plants - 266; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1087 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2535702..2537630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20849.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 185 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASEARESPA NNPGLSTNRD EATKGYIMQQ TMFRIKDPKA SLDFYSRVLG MSLLKRLDFS EMKFSLYFLG YEDTTTAPTD PTERTVWTFG QPATIELTHN 101: WGTESDPEFK GYHNGNSEPR GFGHIGVTVD DVHKACERFE ELGVEFAKKP NDGKMKNIAF IKDPDGYWIE IFDLKTIGTT TVNAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)