AT1G64460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.954 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: inositol or phosphatidylinositol kinase activity, phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic (InterPro:IPR000403); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphoinositide 4-kinase gamma 4 (TAIR:AT2G46500.2); Has 396 Blast hits to 387 proteins in 77 species: Archae - 0; Bacteria - 16; Metazoa - 24; Fungi - 0; Plants - 274; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 82 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23943688..23944680 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33177.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 301 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQDSSGLNYV SVFKPMDEEP MAVNNPQQLP VSSDGQGLKR GTRVGEGATR EVAAYLLDHP KSGLRSVSKE VMGFAGVPPT AMVRSSHKVY NYPNGFSSCA 101: TKDAKVGSLQ MFMKNNGSCE DIGPGAFPVE EVHKICVFDI RMANADRHAG NILTGKSEEG KTLLIPIDHG YCLPENFEDC TFEWLYWPQA KLPFSADTID 201: YINSLDSEQD IALLQLHGWN VPEAVSRTLR ISTMLLKKGV ERNLTPYQIG SVMCRETVNK DSAIEEIVRE AHNSVLPASS EATFLEAVSV AMDRRLDELT 301: K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)