AT4G23230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 15 (CRK15); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 (TAIR:AT4G23160.1); Has 121584 Blast hits to 120147 proteins in 4447 species: Archae - 110; Bacteria - 13930; Metazoa - 44451; Fungi - 10585; Plants - 34122; Viruses - 456; Other Eukaryotes - 17930 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:12157827..12159919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56465.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 507 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLRYSDQNIL STLAYDGAWI RMNGNISIDQ NQMNRFKDFV SSTMNQAAVK AASSPRKFYT VKATWTALQT LYGLVQCTPD LTRQDCFSCL ESSIKLMPLY 101: KTGGRTLYSS CNSRYELFAF YNETTVRTQQ APPPLPPSST PLVTSPSLPG KSWNSNVLVV AIVLTILVAA LLLIAGYCFA KRVKNSSDNA PAFDGDDITT 201: ESLQLDYRMI RAATNKFSEN NKIGQGGFGE VYKGTFSNGT EVAVKRLSKS SGQGDTEFKN EVVVVAKLQH RNLVRLLGFS IGGGERILVY EYMPNKSLDY 301: FLFDPAKQNQ LDWTRRYKVI GGIARGILYL HQDSRLTIIH RDLKASNILL DADMNPKLAD FGLARIFGMD QTQENTSRIV GTFGYMAPEY AIHGQFSVKS 401: DVYSFGVLVL EIISGKKNNS FYETDGAHDL VTHAWRLWSN GTALDLVDPI IIDNCQKSEV VRCIHICLLC VQEDPAERPI LSTIFMMLTS NTVTLPVPLQ 501: PGFPVQS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)