AT3G26280.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.482 endoplasmic reticulum 0.438 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cytochrome P450 monooxygenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 4 (CYP71B4); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 25 (TAIR:AT3G26270.1); Has 33116 Blast hits to 32807 proteins in 1665 species: Archae - 46; Bacteria - 3062; Metazoa - 12210; Fungi - 6959; Plants - 9691; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1145 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9630358..9631970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57792.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 504 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSLLSFFLL LLVPIFFLLI FTKKIKESKQ NLPPGPAKLP IIGNLHQLQG LLHKCLHDLS KKHGPVMHLR LGFAPMVVIS SSEAAEEALK THDLECCSRP 101: ITMASRVFSR NGKDIGFGVY GDEWRELRKL SVREFFSVKK VQSFKYIREE ENDLMIKKLK ELASKQSPVD LSKILFGLTA SIIFRTAFGQ SFFDNKHVDQ 201: ESIKELMFES LSNMTFRFSD FFPTAGLKWF IGFVSGQHKR LYNVFNRVDT FFNHIVDDHH SKKATQDRPD MVDAILDMID NEQQYASFKL TVDHLKGVLS 301: NIYHAGIDTS AITLIWAMAE LVRNPRVMKK AQDEIRTCIG IKQEGRIMEE DLDKLQYLKL VVKETLRLHP AAPLLLPRET MADIKIQGYD IPQKRALLVN 401: AWSIGRDPES WKNPEEFNPE RFIDCPVDYK GHSFELLPFG SGRRICPGIA MAIATIELGL LNLLYFFDWN MPEKKKDMDM EEAGDLTVDK KVPLELLPVI 501: RISL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)