AT4G09900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.795 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methyl esterase 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein predicted to act as a carboxylesterase. It has similarity to the SABP2 methyl salicylate esterase from tobacco. This protein does not act on methyl IAA, methyl JA, MeSA, MeGA4, or MEGA9 in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
methyl esterase 12 (MES12); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: methyl esterase 14 (TAIR:AT1G33990.1); Has 2424 Blast hits to 2424 proteins in 522 species: Archae - 7; Bacteria - 1330; Metazoa - 8; Fungi - 32; Plants - 631; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 416 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:6221767..6223924 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38931.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 349 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNRVICMKK KDVVIRSGGD GSRSKRVNRS QRKLLADEEN LHRRALSMAI HQAQVSQRFD GSMSRRIGST SSRRGTLSDS FSNNKQVPEF LESLKVKKFV 101: LVHGEGFGAW CWYKTIASLE ESGLSPVTVD LAGSGFNMTD ANSVSTLEEY SKPLIELIQN LPAEEKVILV GHSTGGACVS YALERFPEKI SKAIFICATM 201: VTDGQRPFDV FADELGSAER FMKESQFLIY GNGKDNPATG FMFEKQHMKG LYFNQSPNKD IALSMISMRP VPLGPMMEKL SLSAERYGKG RRFYVQTLDD 301: LALSPDVQEK LVRENSPEAV FKIKGSDHCP FFSKPQSLHK ILLEIAQIP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)