AT5G66450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphatidic acid phosphatase (PAP2) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphatidic acid phosphatase (PAP2) family protein; FUNCTIONS IN: catalytic activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase (InterPro:IPR000326); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphatidic acid phosphatase (PAP2) family protein (TAIR:AT3G50920.1); Has 319 Blast hits to 319 proteins in 143 species: Archae - 0; Bacteria - 10; Metazoa - 89; Fungi - 89; Plants - 87; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 44 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26534801..26535951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31531.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 286 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAASSSSLLL LHKPTYNFHF AASSVPTYIN SARFRISSSI FPLDRRRRRR IWSVSGFKSM ADLVKTNARR DGEDRFQALE QEAFISNSSS ELQNELVSDA 101: GDGIEAIANR LSKWIVAALF GSVLLLRHDG AALWAVIGSV SNSVLSVALK RILNQERPVA TLRSDPGMPS SHAQSISFIS VFSVFSVMEW LGTNVLSLFL 201: SGFILALGSY FTWLRVSQKL HTTSQVVVGA IVGSVYSTLW YVTWNSLVLE AFTSTFSVQI ALFLVAAASA LGFAVYVLLN WFKDDR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)