AT5G26940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein; FUNCTIONS IN: exonuclease activity, nucleic acid binding; LOCATED IN: intracellular, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Exonuclease (InterPro:IPR006055), Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H fold (InterPro:IPR012337), Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III (InterPro:IPR013520); Has 3712 Blast hits to 3712 proteins in 1305 species: Archae - 2; Bacteria - 3079; Metazoa - 40; Fungi - 0; Plants - 53; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 534 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:9481429..9482647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35249.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 316 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCISISQVSR LRIHSFGSSC CERVHGWIKN SSSLKLLDVR ASSVDGKARW IRRNVSTTTQ GSRSNTKSSV LGGTVPVTRI IDEESRTKVQ PFGNLQQRLA 101: QDKDLSKLLT VIVSDLETTG LHRKNERIIE IAAQDIAGGG YSTFQTLVNP GVVPITNAHI HGIRNDMVCR PEVPRMEELI PIFLRYVESR QKPGGYVMLV 201: AHNGKSFDFQ FLINEFNRCS YEIPHNWLLL DSLPLARENM KSVEPTVKLS SSLEALADYY SLTREGDAHR ALSDVLLLSK VFQKLTIDLK LSLSDLVLRC 301: HTASDISAAM AKNKKA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)