AT4G35460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NADPH-dependent thioredoxin reductase B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
NADPH-dependent thioredoxin reductase 1 (NTR1. Similar to E.coli NTR and has conserved NADPH binding domains. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NADPH-dependent thioredoxin reductase B (NTRB); FUNCTIONS IN: thioredoxin-disulfide reductase activity; INVOLVED IN: pollen germination, thioredoxin biosynthetic process, cell growth, seed development, cell redox homeostasis; LOCATED IN: cytosol, mitochondrion, chloroplast envelope; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site (InterPro:IPR008255), FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II (InterPro:IPR000103), Thioredoxin reductase (InterPro:IPR005982), Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region (InterPro:IPR001327); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NADPH-dependent thioredoxin reductase A (TAIR:AT2G17420.1); Has 22764 Blast hits to 22762 proteins in 2961 species: Archae - 698; Bacteria - 15900; Metazoa - 139; Fungi - 313; Plants - 208; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5506 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:16842218..16843740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39628.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 375 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNCVSRLKCL ISKARSFARL GGESTLSQPP SLASAAFSSS AVMNGLETHN TRLCIVGSGP AAHTAAIYAA RAELKPLLFE GWMANDIAPG GQLTTTTDVE 101: NFPGFPEGIL GVELTDKFRK QSERFGTTIF TETVTKVDFS SKPFKLFTDS KAILADAVIL ATGAVAKRLS FVGSGEASGG FWNRGISACA VCDGAAPIFR 201: NKPLAVIGGG DSAMEEANFL TKYGSKVYII HRRDAFRASK IMQQRALSNP KIDVIWNSSV VEAYGDGERD VLGGLKVKNV VTGDVSDLKV SGLFFAIGHE 301: PATKFLDGGV ELDSDGYVVT KPGTTQTSVP GVFAAGDVQD KKYRQAITAA GTGCMAALDA EHYLQEIGSQ QGKSD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)