AT5G14800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pyrroline-5- carboxylate (P5C) reductase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase, catalyzes the final step in proline biosynthesis from glutamate and ornithine.In situ hybridization indicated that under normal growth conditions, the highest concentration of P5CR transcripts occurs in the cortical parenchyma, phloem, vascular cambium and pith parenchyma in the vicinity of the protoxylem. Single gene in Arabidopsis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pyrroline-5- carboxylate (P5C) reductase (P5CR); FUNCTIONS IN: pyrroline-5-carboxylate reductase activity; INVOLVED IN: response to salt stress, response to heat, proline biosynthetic process; LOCATED IN: cell wall, cytoplasm; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent (InterPro:IPR004455), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase (InterPro:IPR000304); Has 7885 Blast hits to 7882 proteins in 2434 species: Archae - 115; Bacteria - 5234; Metazoa - 373; Fungi - 241; Plants - 70; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1852 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:4786190..4787618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28625.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 276 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEILPIPAES FKVGFIGAGK MAESIARGVV ASGVLPPNRI CTAVHSNLNR RDVFESFGVN VFSTSEEVVK ESDVVIFSVK PQVVKKAVTE LKSKLSKNKI 101: LVSVAAGIKL NDLQEWSGQD RFIRVMPNTP AAVGEAASVM SLGTGATEED GAIVAMLFGA VGKILKADEK MFDAVTGLSG SGPAYIFLAI EALADGGVAA 201: GLPRELALSL ASQTVLGAAT MVSKTGKHPG VLKDDVTSPG GTTIAGVHEL EKGSFRATLM NAVVAAAKRS RELSQS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)